Die beste Reisezeit variiert je nach Region. Wir von Lonely Planet warnen: Die Ostküste von Malaysia (z. B. die Perhentian- oder Tioman-Inseln) erlebt von November bis Februar eine ausgeprägte Regenzeit, in der viele Resorts schließen. An der Westküste, etwa in Kuala Lumpur, Penang oder Langkawi, ist das Wetter hingegen ganzjährig relativ stabil mit nur kurzen Regenphasen. Für Borneo gilt ebenfalls: Die Trockenzeit von März bis Oktober ist ideal für Natur- und Tierbeobachtungen. Insgesamt sind die Monate von März bis Oktober am besten für die meisten Regionen geeignet.
Die beste Reisezeit für Malaysia sind die Monate März und April. In dieser Zeit wird eine durchschnittliche Temperatur in Höhe von 33° Celsius erreicht. Die sonnigsten Monate sind die Monate Februar, März, Juni und Juli mit durchschnittlich 7 Sonnenstunden pro Tag. Im Vergleich hierzu liegt die Temperatur in den kältesten Monaten bei lediglich 32° Celsius bei durchschnittlich 11 Regentagen. Im Jahresmittel liegt die durchschnittliche Tagestemperatur bei 32° Celsius und die Nachttemperatur bei 23° Celsius. Im Schnitt regnet es jeden Monat an 14 Tagen. Der regenreichste Monat ist der Oktober.